您可以在“序列”下的方框内输入您的多肽序列（氨基端→羧基端），输入的格式可以为氨基酸的1字符或3字符，也可两者混合输入。 氨基端可供选择的修饰有乙酰化、生物素标记、焦谷氨酸化；羧基端可选择酰胺化。 输入目标序列，可很迅速的计算出该多肽的分子量。 等电点即为目标多肽所带净电荷为零时的PH，其计算方法以具权威的“Lehninger Principles of Biochemistry”为依据。 PH为7时的净电荷是指在PH=7的溶液中目标多肽所带的净电荷；当然，您还可以根据“Net charge”图表了解到在不同PH条件下目标多肽的净电荷情况。 平均亲水性是根据多肽序列中各氨基酸残基以及不同修饰的亲/疏水值来得到的。从一条肽的平均亲水性值，我们可以判断其在水的溶解性如何。

平均亲水性值为2～3：	说明该多肽的溶解性非常的好；即使多肽短暂的与空气接触，也有吸潮的可能。为解决这个问题，建立了能将空气湿度大大降低的类GMP级实验室，多肽的分装工作都在此实验室中完成；同时，在发货的时候我们也会在多肽包装盒内放置高效的吸潮剂，大限度的降低了多肽吸潮的可能性。
平均亲水性值为0～2：	一般来讲，这样的多肽在水中溶解性都很好；无需添加助溶剂亦可取得较好的溶解效果。
平均亲水性值为=0：	多肽在水中的溶解性一般；可以通过以下方法来增加多肽的溶解性：1调整溶液的PH助溶； 2 超声助溶； 3 调整溶液温度（≤30℃）助溶； 4 添加助溶剂（如DMSO，DMF等），建议先将肽溶于有机溶剂，再缓慢加入水或其它缓冲溶液。 5 对于碱性肽，建议用10%乙酸溶解，对于酸性肽，建议用10%NH4HCO3溶解。
平均亲水性值为0～-2：	多肽在水中的溶解性较差；您可以利用以上5种方法助溶，同时也可在多肽序列中增加亲水性氨基酸，以增加多肽的亲水性。
平均亲水性值为-2～-3：	多肽在水中的溶解性非常的差；导致多肽很难纯化，多肽纯度亦很难提高，客户在运用这种多肽的时候，也会遇到多肽异常难溶的问题。遇到这种情况，我们一般会建议客户更换序列或在现有序列中加入亲水性氨基酸。

另外，多肽的溶解度还与其二级结构、修饰标记物的性质以及溶剂类型和终浓度有关系。 指多肽序列中亲水性氨基酸残基数占总残基数的百分比。